孔府与十二府的关系在孔府，衍圣公爵位由嫡长子继承，住在内宅，如有弟弟就要搬出去分别住在外面的十二府里。十二府类似满清时代的亲王府，十二府并不是十二个府，而是当初修建时按照大排行叫的，行几就叫几分府，一共有九个府:大、二、三、四、五、七、八、十、十二。其中，大府是庶出长子，还有个一贯堂，在孔府里面，因为当初分出去的时候外面没房子，也盖在孔府里面了，仍和外面的十二府一样，分开单独过。衍圣公的兄弟搬出去时，除了给房子，还要给买一部分田地，但数量不多，不过几十亩，孔府的祖赐祭田虽然很多，但不能动。衍圣公的兄弟没有封号，明朝曾封衍圣公次子为世袭翰林院五经博士，三子为世袭太常寺博士。十二府没有世袭俸禄，土地不多，经济状况很不稳定。十二府每个府都有堂号，其中有几个府跟孔府关系近，五府是凝远堂，十府是凝道堂，十二府是凝静堂，另外一贯堂是凝祉堂，再加上孔府叫凝绪堂，这五府合称五凝堂。未代衍圣公孔德成是老公爷孔令贻的遗腹独子，孔令贻及其父孔祥珂皆为独子，因而，清未民初十二府里没有很近的本家，比较近的是孔令贻的叔伯堂兄孔令誉，住在五府，其妻乃袁世凯的妹妹，因其无子，死后由孔德成代替儿子"摔盆"。五府的建筑在十二府中讲究，有些独特设计，如园中的假山，山石像个巨大的灵芝，房子也很多，分为东五府、西五府、南五府、南府。南五府是按严嵩家的样子修建的，其孙女嫁入孔府后，怕她想家，故依其娘家式样修建。衍圣公对住在十二府的兄弟及近支既用又防，就像大清雍正皇帝与其兄弟及儿子们的关系一样。当衍圣公年幼、生病、外出或其它情况不能组织正常的祭孔大典时，一般让一位叔伯或兄弟暂时代祭，衍圣公兄弟也参加孔府的日常管理，对维护公府利益和安全起到了很大作用。但是，当社会动乱，主支衰微，公爷年幼等特殊情况时，他们又成了觊觎圣府，伺机篡位的主要力量。东门大街西首路北的十二府，是孔子68代嫡孙衍圣公孔传铎第五子孔继涑的府第。孔继涑一生勤奋好学，才华出众，很有名望。据说乾隆年间，皇宫有人夜观天象，见代表皇权的紫微星发暗，旁边一颗小星却格外明亮，经天鉴官占卜，算出那颗比紫微星还明亮的小星应在山东孔府某人身上。乾隆立即派人调查，发现孔继涑的十二府是按八卦样式建造的，且九间正房的房脊连在一起，犯了皇家禁忌。另外，还发现孔庙大成殿前的柏树主干枯萎，侧枝繁茂，说是孔继涑"念咒语发二枝"，阴谋篡夺衍圣公爵位等种种罪证，于是孔继涑被开除孔氏家族。成为孔府"三大案"之一。其实，孔继涑谋逆篡位纯属捏造，而其过多参与孔府事务引起嫁入孔府的乾隆女儿"于氏"不满是真。欲加之罪，何患无辞。孔继涑"获罪"后，十年足不出户，用全部精力研究、搜集历代名家碑帖，整理保存古代珍贵碑帖五百多块，结集为"玉虹楼碑帖"，成为孔府的传世之宝。孔继涑到死也没解除罪名，发丧时不许用乐器，埋葬时不许葬入孔林，用三道铁链锁棺，埋在了孔林外边的野地里。